Первый случай варианта омикрона обнаружен в Испании у путешественника из ЮАР

Испанские больницы уже начали поиск нового штамма коронавируса, используя в качестве ориентира генетическое секвенирование, а также результаты ПЦР.

Испания пытается защитить себя от нового варианта коронавируса, получившего обозначение омикрон. Мутации вируса, обнаруженные неделю назад в Южной Африке и Ботсване, были обнаружены в полдюжине европейских странах, и испанские больницы уже ищут их.

В понедельник отделение микробиологии больницы Грегорио Мараньона в Мадриде подтвердило первый выявленный в Испании случай нового варианта. Его нашли у путешественника, приехавшего из Южной Африки.

«Нам удалось использовать сверхбыструю процедуру, которая позволяет получить результат в тот же день. Пациент чувствует себя хорошо», – пояснила лаборатория больницы через свой аккаунт в Twitter.

По мере продвижения поиска этого варианта Министерство здравоохранения Испании усилило контроль над всеми пассажирами, прибывающими в Испанию с юга Африки: пассажиры, прибывающие из Южной Африки, Ботсваны, Эсватини, Лесото, Мозамбика, Намибии и Зимбабве, будут помещены в карантин на 10 дней.

В то же время больничные лаборатории Испании активно пытаются найти новый вариант. Европейский Союз призвал государства-члены начать секвенирование от 5 до 10% результатов диагностических тестов. Это та пропорция, которую они считают достаточной для обнаружения мутации, которая уже циркулирует на территории.

Поскольку процесс секвенирования может занять до двух дней, учитывая его сложность, текущие тесты ПЦР могут опередить эту работу, обнаруживая наличие (или отсутствие) конкретных мутаций в анализируемом образце всего за несколько часов. Это позволяет предположить, что новый обнаруженный случай может соответствовать варианту, выявленному неделю назад в Южной Африке и Ботсване.

Например, тест ПЦР от бренда Thermo Fisher ищет мутации в трех разных частях вируса.

Хуан Карлос Галан, руководитель отдела вирусологии больницы Рамон-и-Кахаль, поясняет: «Первая информация, которая у нас есть, указывает на то, что мутация нового варианта означает, что тест ПЦР не обнаруживает ген S. Если образец дает положительный результат на этот ген, то ясно, что это не вариант омикрона. Но если вы получите отрицательный результат для гена S и положительный результат для двух других целей, это позволяет предположить, что это так. Хотя нельзя исключать, что другие варианты могут дать такой же результат, а это означает, что всегда будет необходимо генетическое секвенирование».

Больница Сан-Сесилио в Гранаде, в которой находится ведущее отделение микробиологии в восточной Андалусии, разработала другую систему, которая позволила идентифицировать дельта-вариант, сосредоточив внимание на двух частях вируса.

Федерико Гарсия, руководитель отдела микробиологии в Сан-Сесилио, объясняет: «Результаты, которые мы получаем с дельта-вариантом, на который в настоящее время приходится более 90% положительных случаев, будут отличаться от омикрона, в котором отсутствуют целевые мутации, используемые для дельта. Это позволило бы нам заподозрить случай омикрона, хотя он должен быть подтвержден с помощью генетического секвенирования, которое все еще является эталонным тестом».